Посёлок Каркатеевы был основан в середине 40-х годов. Однако его история уходит корнями глубоко в историю края. Самые ранние сведения сохранились в материалах ревизии населения Российской империи 1782 года. В перечне населения ханты Подгорно-Юганской волости записана фамилия Каркатеевы. От неё и идёт название посёлка.В материалах десятой ревизии 1852 года Подгорно-Юганской волости Сургутского уезда отмечено поселение юрты Каркатеевы.
В материалах Приполярной переписи 1926-1927 годов Юрты Каркатеевы относились к Тундринскому сельсовету. В них числились одно хозяйство и шесть жителей. Основными занятиями хантов юрт Каркатеевы были охота и рыболовство.
По воспоминаниям старожилов, в 30-40 годы каркатеевские ханты покинули свои земли. Сейчас в Нефтеюганском, районе ханты с фамилией Каркатеевы не проживают. Первое постоянное русское поселение на Горной протоке возникло в конце 30-х - начале 40-х годов 20 века. Оно просуществовало недолго. По воспоминаниям старожил, в конце сороковых - начале пятидесятых годов посёлок был расформирован по соседним деревням. Часть жителей и построек были перевезены в п.Чеускино, часть - в п.Майский, остальные переехали на место расположения современного посёлка. «Переехало» сюда и название – «Каркатеевы». Старое «Каркатеевы» находится неподалёку, в сторону п.Пойковского, там до сих пор угадываются остатки построек.
Примерно в 1947 году на новом месте был основан леспромхоз, который специализировался на заготовке древесины кедра. Чуть позже от леспромхоза отделился сплав участок.
Создание леспромхоза и сплав участка привело к росту численности населения посёлка. Летом 1948 года в Каркатеевы прибыла небольшая - около 20 человек - партия ссыльных крестьян с Украины. Позже стали приезжать сезонные рабочие. В конце 50-х годов в поселке отсутствовали важные соци-альные объекты - жильё и медицинский пункт. Люди жили в самостроях, бараках и землянках по берегу Горной протоки. Электричества и водопровода в этих жилищах не было. Печки для отопления изготавливались из разрезанных железных бочек. Начальное образование дети получали в посёлке. За медицинской помощью серьёзно заболевшим людям, приходилось отправляться в г.Сургут.
В 1952 году после закрытия леспромхоза и сплав участка большая часть жителей посёлка уехала. Освободившиеся дома и контору разобрали и перевезли в п.Чеускино. В п.Каркатеевы остались несколько домиков и безработные люди. Оставшиеся семьи жили за счет подсобного хозяйства, охоты и рыболовства.
Новое развитие поселка началось с открытием нефтегазоносных месторождений и строительства нефтеперекачивающей станции. В конце 60-х годов активно начали строить в первую очередь станции. Затем приступили к строительству первых жилых домов и социально значимых объектов.
Головным предприятием поселка является Линейная производственная диспетчерская станция «Каркатеевы». На территории поселка функционируют подразделения Нефтеюганского управления магистральных нефтепроводов: цех технологического транспорта и спецтехники, участок погрузочно-разгрузочных работ, база производственного обслуживания. Несет противопожарную охрану пожарная часть № 25. Зарегистрировано 19 предприятий и организаций различных форм собственности и две управляющих компании.